Īstenots projekts Nr.22-00-S0ZF05-000005 Zinātniskā institūta „BIOR” dalība mācību kursos "Workshop on Population and Speciation Genomics"
No 2022. gada 5. līdz 17. jūnijam norisinājās ceturais organizētais mācību kurss “Workshop on Population and Speciation Genomics ” Čehijā, Česki Krumlovā, piedaloties vairāk kā 60 dalībniekiem no 23 dažādām valstīm un 25 skolotājiem un speciālistiem.
Starptautisko konferenci rīkoja vietnes evomics.org mācībspēku grupa, kas organizē dāžādus seminārus un kursus no dažādām iestādēm visā pasaulē. Semināru par populāciju un sugu genomiku organizē un kopīgi vada:
Valters Zalcburgers, Bāzeles Universitāte;
Michael Matschiner, Cīrihes Universitāte;
Jans Stefka, Bioloģijas centrs CAS, Česke Budějovice;
Skots Handlijs, Vašingtonas Universitāte;
Emiliano Trucchi, Ferrāras Universitāte;
Jūlija M.I. Bārta, Oslo Universitāte;
Britta S. Meijere, Helmholca Okeāna izpētes centrs Ķīle – GEOMAR;
Milans Malinskis, Bāzeles Universitāte.
Šis kurss apvieno starptautisku mācībspēku un semināra dalībniekus, lai pētītu un apspriestu pašreizējās idejas un metodes genoma datu analīzei par populāciju un cieši saistīto sugu līmeni. Seminārs sastāv no lekciju sērijām, demonstrācijām un praktiskajiem uzdevumiem, kas aptver populācijas un sugu genomikas analīzes teoriju un praksi.
Kopā 16 dienās tika aizvadītas 40 h klausoties lekcijas un 50 h strādājot praktiski ar uzdevumiem datortelpā. Tika apgūtas tādas programmas kā UNIX, jupyter notebook, Amazon Web Services (AWS), genome-wide association study (GWAS), fastsimcoal, machine learning (ML), D-statistics, ANGSD u.c.